MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 megaplasmid

Total Repeats: 4834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015851	GC	3	6	104929	104934	0 %	0 %	50 %	50 %	340783724
2002	NC_015851	AAG	2	6	105023	105028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783724
2003	NC_015851	TTG	2	6	105186	105191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783724
2004	NC_015851	CAT	2	6	105246	105251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783724
2005	NC_015851	AAC	2	6	105366	105371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783724
2006	NC_015851	GAAA	2	8	105567	105574	75 %	0 %	25 %	0 %	340783724
2007	NC_015851	GA	3	6	105588	105593	50 %	0 %	50 %	0 %	340783724
2008	NC_015851	TCAT	2	8	105780	105787	25 %	50 %	0 %	25 %	340783724
2009	NC_015851	ATC	2	6	105801	105806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783725
2010	NC_015851	A	6	6	105808	105813	100 %	0 %	0 %	0 %	340783725
2011	NC_015851	ATGT	2	8	105843	105850	25 %	50 %	25 %	0 %	340783725
2012	NC_015851	GC	3	6	105917	105922	0 %	0 %	50 %	50 %	340783725
2013	NC_015851	T	6	6	105937	105942	0 %	100 %	0 %	0 %	340783725
2014	NC_015851	TC	3	6	106039	106044	0 %	50 %	0 %	50 %	340783725
2015	NC_015851	GTT	2	6	106078	106083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783725
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2018	NC_015851	A	6	6	106195	106200	100 %	0 %	0 %	0 %	340783725
2019	NC_015851	GCC	2	6	106231	106236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783725
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2021	NC_015851	GA	3	6	106339	106344	50 %	0 %	50 %	0 %	340783725
2022	NC_015851	AGC	2	6	106380	106385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783725
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2035	NC_015851	GTT	2	6	107077	107082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783725
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2042	NC_015851	CGGTAC	2	12	107396	107407	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783725
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2057	NC_015851	GAT	2	6	108263	108268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783726
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2064	NC_015851	TTTA	2	8	108751	108758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2098	NC_015851	ATC	2	6	110996	111001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2103	NC_015851	GAT	2	6	111239	111244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2105	NC_015851	TGT	2	6	111295	111300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2109	NC_015851	TGA	2	6	111625	111630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783729
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2113	NC_015851	CGTC	2	8	111768	111775	0 %	25 %	25 %	50 %	340783729
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2122	NC_015851	GAT	2	6	112204	112209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783729
2123	NC_015851	CGG	2	6	112266	112271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783730
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2125	NC_015851	GGC	2	6	112378	112383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783730
2126	NC_015851	AGC	2	6	112432	112437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783730
2127	NC_015851	TGC	2	6	112448	112453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783730
2128	NC_015851	GCC	2	6	112487	112492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783730
2129	NC_015851	TGC	2	6	112595	112600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783730
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2131	NC_015851	TGGC	2	8	112622	112629	0 %	25 %	50 %	25 %	340783730
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2133	NC_015851	AGT	2	6	112660	112665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783730
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2139	NC_015851	CTGC	2	8	113268	113275	0 %	25 %	25 %	50 %	340783730
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2143	NC_015851	GGCGGT	2	12	113543	113554	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2144	NC_015851	CCAA	2	8	113605	113612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2145	NC_015851	CGC	2	6	113617	113622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2146	NC_015851	GC	4	8	113672	113679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2147	NC_015851	TC	4	8	113682	113689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2148	NC_015851	GA	3	6	113693	113698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2149	NC_015851	CCG	2	6	113791	113796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2150	NC_015851	CGA	2	6	114082	114087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783732
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2154	NC_015851	ATC	2	6	114228	114233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783732
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2159	NC_015851	CGA	2	6	114440	114445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783732
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2162	NC_015851	CCT	2	6	114688	114693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783733
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2166	NC_015851	TGG	2	6	114945	114950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2167	NC_015851	TC	3	6	114968	114973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2168	NC_015851	ATA	2	6	115013	115018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2169	NC_015851	GCAA	2	8	115039	115046	50 %	0 %	25 %	25 %	340783734
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2179	NC_015851	CTA	2	6	115619	115624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2199	NC_015851	TCA	2	6	116607	116612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783736
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2224	NC_015851	ATTT	2	8	118224	118231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2225	NC_015851	T	6	6	118229	118234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2226	NC_015851	CCT	2	6	118251	118256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2227	NC_015851	CCG	2	6	118273	118278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2228	NC_015851	GAT	2	6	118308	118313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2229	NC_015851	TGAT	2	8	118401	118408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2230	NC_015851	TGC	2	6	118488	118493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2231	NC_015851	ATT	2	6	118496	118501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2232	NC_015851	TGA	2	6	118506	118511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2233	NC_015851	ATT	2	6	118578	118583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2239	NC_015851	TCA	2	6	118926	118931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783738
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2244	NC_015851	CGT	2	6	119100	119105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783738
2245	NC_015851	GCAT	2	8	119170	119177	25 %	25 %	25 %	25 %	340783738
2246	NC_015851	ACC	2	6	119222	119227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783738
2247	NC_015851	TC	3	6	119239	119244	0 %	50 %	0 %	50 %	340783738
2248	NC_015851	ATT	2	6	119305	119310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783738
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2250	NC_015851	CG	3	6	119376	119381	0 %	0 %	50 %	50 %	340783738
2251	NC_015851	CAA	2	6	119503	119508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2252	NC_015851	GAT	2	6	119522	119527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2253	NC_015851	GCT	2	6	119542	119547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2254	NC_015851	CGT	2	6	119572	119577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_015851	CGCT	2	8	119618	119625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2256	NC_015851	GGC	2	6	119649	119654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2257	NC_015851	TCT	2	6	119770	119775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783739
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2334	NC_015851	GTC	2	6	123198	123203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2335	NC_015851	AGCAT	2	10	123426	123435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2353	NC_015851	TTG	2	6	124124	124129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783746
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2357	NC_015851	GGC	2	6	124233	124238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2358	NC_015851	CAT	2	6	124272	124277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2359	NC_015851	TGA	2	6	124281	124286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2360	NC_015851	AGC	2	6	124316	124321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2361	NC_015851	TGC	2	6	124328	124333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2362	NC_015851	CCCTC	2	10	124337	124346	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2363	NC_015851	CGCC	2	8	124362	124369	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2364	NC_015851	T	6	6	124408	124413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2365	NC_015851	TTCC	2	8	124415	124422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2366	NC_015851	AGCGAC	2	12	124430	124441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2367	NC_015851	CG	3	6	124572	124577	0 %	0 %	50 %	50 %	340783747
2368	NC_015851	CTCC	2	8	124601	124608	0 %	25 %	0 %	75 %	340783747
2369	NC_015851	GCG	2	6	124736	124741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783748
2370	NC_015851	TAC	2	6	124783	124788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783748
2371	NC_015851	CGA	2	6	124834	124839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2372	NC_015851	T	7	7	124869	124875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2373	NC_015851	AG	3	6	124946	124951	50 %	0 %	50 %	0 %	340783749
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2495	NC_015851	ACC	2	6	130438	130443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783755
2496	NC_015851	CGGA	2	8	130444	130451	25 %	0 %	50 %	25 %	340783755
2497	NC_015851	TCC	2	6	130538	130543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783755
2498	NC_015851	TCG	2	6	130583	130588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783755
2499	NC_015851	GCG	2	6	130619	130624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783755
2500	NC_015851	GAA	2	6	130783	130788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783755

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